Analiza wielogenowego panelu molekularnego raka jelita grubego u chorych do 50. roku życia – wstępne wyniki polskiego ośrodka

Wprowadzenie
Rak jelita grubego (CRC), jeden z najczęściej występujących nowotworów, stanowi poważny problem zdrowia publicznego na świecie, zwłaszcza w krajach zachodnich. W Polsce, zarówno u mężczyzn, jak i u kobiet, CRC jest nowotworem o dużej zapadalności i zajmuje 2. oraz 3. miejsce pod względem zachorowalności i zgonów. Dzięki kamieniom milowym w analizie molekularnej i głębszemu wglądowi w szlaki molekularne możliwe jest obecnie spersonalizowane leczenie. Technologia sekwencjonowania nowej generacji (NGS) umożliwia panelową detekcję wielu genów, a tym samym identyfikację osób z mutacjami predysponującymi do nowotworów.

Cel pracy
W niniejszym badaniu poddano analizie badania molekularne raka jelita grubego u pacjentów ≤ 50. roku życia.

Materiał i metody
Do kryteriów włączenia zakwalifikowano pacjentów bez wcześniejszej radio- i chemioterapii. Wyizolowano DNA z FFPE. Użyto panelu Illumina Hot-Spot Cancer Panel zawierającego 50 genów (700 amplikonów).

Wyniki
Mediana wieku wynosiła 43 lata. Stosunek liczby kobiet do liczby mężczyzn wynosił 1 : 1. Odnotowano następujące częstości mutacji: TP53 76%, APC 57%, KRAS 43%, NRAS 29%, SMAD4 9%, PIK3CA 14% i FBXW7 5%. Stwierdzono współwystępowanie APC/mutacja KRAS/TP53 u 20% pacjentów.

Wnioski
Współwystępowanie mutacji wykazano u 86% chorych, najczęściej u 2 lub 3 chorych. IDH1 stwierdzono jedynie u chorych z lepszym rokowaniem, natomiast mutacje TP53, APC i KRAS występowały istotnie częściej u chorych z gorszym rokowaniem.



Introduction
Colorectal cancer (CRC), one of the most common cancers, is a major public health issue globally, especially in Western countries. In Poland, both in men and women, CRC is a cancer with a high incidence and occupies the 2nd–3rd position among morbidity and deaths. Because of milestones in molecular analysis and deeper insight into molecular pathways, personalised treatment is now possible. Next-generation sequencing (NGS) technology enables panel detection of many genes and therefore identification of people with cancer-predisposing mutations.

Aim of the research
In the current study we analysed molecular studies of colorectal cancer in patients ≤ 50 years of age.

Material and methods
We qualified patients without prior radio- and chemotherapy into the inclusion criteria. We isolated DNA from FFPE. We used the Illumina Hot-Spot Cancer Panel containing 50 genes (700 amplicons).

Results
The median of age was 43 years. The female : male ratio was 1 : 1. We recorded the following mutation frequencies: TP53 76%, APC 57%, KRAS 43%, NRAS 29%, SMAD4 9%, PIK3CA 14%, and FBXW7 5%. We noted the co-occurrence APC/KRAS/TP53 mutation in 20% of patients.

Conclusions
Co-occurrence of mutations was found in 86% of patients, most often 2 or 3. IDH1 was found only in patients with a better prognosis, while the TP53, APC, and KRAS mutations occurred significantly more often in patients with a worse prognosis.