Odkrycie nowego wirusa powszechnie występującego w jelicie

Liczba artykułów naukowych dotyczących mikroflory jelitowej opublikowanych w 2013 roku była czterdziestokrotnie większa niż w 2003 roku. Ilustruje to znaczenie mikroflory jelitowej w zdrowiu i chorobie, które zaczyna być doceniane przez lekarzy i naukowców [1]. Wraz z lepszym poznaniem tego zagadnienia tematyka badań uległa rozszerzeniu na czynniki modyfikujące skład i funkcjonowanie bakterii znajdujących się w świetle przewodu pokarmowego.

Jednym z głównych naturalnie występujących czynników regulujących ekosystemy bakteryjne, w tym ich różnorodność, są bakteriofagi. W niektórych krajach są one wykorzystywane w terapii zakażeń; wiadomo, że spersonalizowane terapie bakteriofagami mogą cechować się wysoką skutecznością w przypadkach zakażeń wysoce opornych na inne leczenie. Dutilh i wsp. poszukiwali nowego wirusa analizując odczyty pełnego genomu wszystkich bakterii bytujących w jelitach u różnych osób. Porównując zebrane dane odkryli powtarzający się często fragment, który okazał się być kodem genetycznym wcześniej nieznanego wirusa. Jest szczególnie ciekawe, że nowy wirus, nazwany crAssphage, występuje w dostępnych bazach opisujących kod genetyczny bakterii jelitowych sześciokrotnie częściej niż wszystkie pozostałe znane bakteriofagi. Obecność kodu genetycznego crAssphage stwierdzono w większości badanych próbek pochodzących od różnych osób. Dutilh i wsp. przewidzieli, że wirus najprawdopodobniej zakaża bakterie rodzaju Bacteroides. Liczba tych bakterii w gramie ludzkiego stolca może wynosić nawet 100 miliardów. Opisywane odkrycie z pewnością będzie punktem wyjścia dla dalszych badań.

[1] Raes J. The gut microbiome - a new target for understanding, diagnosing and treating disease. Arch Public Health 2014: 6;72.