Badania mikrobiomu jelit mogą istotnie poprawić diagnostykę chorób

Jak poinformowało 10 stycznia biuro prasowe UJ, badania związane z ustanowieniem wytycznych dotyczących wykorzystania danych mikrobiomu w diagnostyce chorób przeprowadził zespół z Sano – Centrum Medycyny Obliczeniowej, Małopolskiego Centrum Biotechnologii Uniwersytetu Jagiellońskiego i Uniwersytetu w Tartu.

Sposób, w jaki jest analizowany mikrobiom – niewidoczne społeczności bakterii zamieszkujące jelita – ma ogromny wpływ na identyfikację kluczowych mikroorganizmów dla danej choroby – wynika z badań przeprowadzonych przez polsko-estoński zespół, w składzie którego są naukowcy z Uniwersytetu Jagiellońskiego, których wyniki zostały opublikowane w czasopiśmie „Microbiome”.

Autorzy badania zastosowali algorytmy uczenia maszynowego oraz różne techniki transformacji danych do analizy ponad 8,5 tys. próbek pochodzących z 24 różnych zestawów danych mikrobiomu jelit. Celem ich pracy było poprawienie precyzji w rozróżnianiu profili bakterii jelitowych między stanami zdrowia a chorobami, a także uzyskanie głębszego wglądu w to, jak wybór metod analitycznych wpływa na identyfikację kluczowych bakterii.

Mikrobiom pomaga leczyć choroby– Wyniki badań nad ludzkim mikrobiomem oraz prób klinicznych dają nadzieję na to, że jeśli nauczymy się „naprawiać” mikrobiotę jelitową, będziemy mogli skutecznie leczyć wiele chorób lub im zapobiegać – mówi prof. Martin J. Blaser.

Zdaniem autorów badania mikrobioty jelitowej pokazują, że zmiany w jej składzie mogą działać jako naturalne biomarkery; np. określone wzorce w mikrobiomie – zwiększona obfitość niektórych bakterii lub brak innych – mogą wskazywać na wystąpienie poważnych schorzeń, zanim jeszcze pacjent zauważy jakiekolwiek objawy.

– To jak system wczesnego ostrzegania, który może wykryć problemy zdrowotne, zanim pojawią się jakiekolwiek objawy. Nowotwory jelita grubego i trzustki są godnymi uwagi przykładami, w których mikrobiom może poprawić diagnostykę chorób – zaznaczyli naukowcy.

Metody oparte na diagnostyce mikrobiomu – podkreślili w swojej pracy – są mniej inwazyjne i uciążliwe dla pacjentów, oferując nową jakość w medycynie prewencyjnej. Wskazali także na pilną potrzebę standaryzacji metod analizy mikrobiomu, co w połączeniu z mocą sztucznej inteligencji może zmienić sposób, w jaki mikrobiom jest rozumiany i wykorzystywany w medycynie.