Nowa technologia analizy wiadomości przekazywanych przez RNA pomoże w leczeniu raka?

Urządzenia mikroprzepływowe zrewolucjonizowały sekwencjonowanie pojedynczej nici RNA oferując niskokosztową, wysokowydajną metodę znajdująca zastosowanie wobec pojedynczych komórek genomu. Metoda ta ma pewne ograniczenia odnośnie wychwytywania kompletnej transkrybowanej informacji RNA. Dlatego pojawiała się jej nowsza wersja.

Badacze Uniwersytetu Cornella wynaleźli niskokosztową metodę rozwiązującą problem dekodowania informacji jakie niesie RNA, która to nie tylko popycha do przodu kwestię sekwencjonowania pojedynczej nici genomu, ale również może rzucić nowe światło na badania nad infekcjami oraz biologię układu odpornościowego.

Wcześniej badacze Uniwersytetu Harwarda oraz MIT zaprezentowali sekwencjonowanie kropelkowe, metodę pozwalającą na scharakteryzowanie właściwości tysięcy komórek przy wykorzystaniu skali nano oraz dołączając unikalny identyfikator do każdej molekuły RNA. Problemem jest jednak to, że metoda pozwala na identyfikację jedynie niektórych typów wiadomości przekazywanych przez molekuły RNA, co ogranicza spektrum analizy. Tymczasem to RNA przenosi informację genetyczną kopiowaną z DNA w procesie transkrypcji.

Dlatego badacze wymyślili niedrogą zamianę protokołu sekwencjonowania kropelkowego nazywając nową metodę DART, która celuje w pojedyncze komórki. Technologia pozwala na analizę większej liczby molekuł niż poprzednia metoda, a dodatkowo identyfikuje zainfekowane wirusem komórki. Zdaniem badaczy nowa metoda może pomóc w wypracowaniu nowego podejścia do terapii przeciwnowotworowych. Jak wskazują, komórki rakowe są bardzo różnorodną populacją i bez analizy na poziomie najmniejszej możliwej składowej można często przegapić ważną informację. Tymczasem nowa technologia umożliwia taką analizę.